W uroczystość MB Szkaplerznej 16 VII 2018 r. w Czernej w pomieszczeniach Domu Pielgrzyma poświęcono nowo otwarte Muzeum Misyjne. Poświęcenia dokonał J. E. ks. bp Kazimierz Górny z Rzeszowa. Celebransowi towarzyszyli również: prowincjał Krakowskiej Prowincji Karmelitów Bosych o. Tadeusz Florek i kustosz sanktuarium o. Leszek Stańczewski. Obecni byli misjonarze pracujący długie lata w Afryce: o. Sylwan Zieliński, o. Kamil Ratajczak i br. Ryszard Żak.
Muzeum ma charakter narracyjny. Jest nie tylko zbiorem eksponatów przywiezionych z Afryki, ale w sposób nowoczesny opowiada o prawie pięćdziesięcioletniej pracy duszpasterskiej polskich misjonarzy – karmelitów bosych w Rwandzie i Burundi. Multimedia i wystawa przybliżają nam historię misji polskich karmelitów w Afryce, ukazują misyjny trud, a także warunki codziennego życia naszych ojców i miejscowej ludności. W muzeum można również posłuchać muzyki i pieśni w języku kirundi i kinyarwanda, a także wypowiedzi karmelitów bosych o ich pracy. Muzeum jest udostępnione do zwiedzania codziennie w godz. 9.00 – 17.00 (sb. i ndz. do godz. 19.00). Zwiedzanie jest bezpłatne. Dobrowolną ofiarę na misje karmelitańskie można złożyć do skarbonki przy wyjściu z muzeum.